python - 如何在 PyPy 上使用 Biopython？

Question

我知道 PyPy 与 Numpy 和 Biopython 中的其他东西有问题，但并非所有 BioPython 模块都使用这些东西...... 有人知道如何将 Bio 模块导入并使用 PyPy 吗？

Answer 1

您应该能够像常规 Python 版本一样安装它。 PyPy 已包含在 Biopython 的集成测试中。

使用 virtualenvwrapper 的示例:

$ mkvirtualenv -p /usr/bin/pypy biopy
$ workon biopy
$ cd biopython  # or wherever your biopython directory is
$ python setup.py install
$ python -c 'import Bio'

如果您在上述命令中没有看到任何错误消息，那么它应该可以正常工作。