我有一个 nxm 邻接矩阵，其中 (i,j) 表示 i 和 j 之间的关联分数。我需要将其转换为以下格式，例如:i j <score1>
使用 R' igraph 包并将其输出到文本文件中。
我可以推导出边缘列表，但它在没有权重的情况下出现。我使用了以下代码:library(igraph)
g <- graph.adjacency(myAdjacencymatrix)
get.edgelist(g)
但是，它没有显示权重。
最佳答案
library(igraph)
set.seed(1) # for reproducible example
myAdjacencyMatrix <- matrix(runif(400),nc=20,nr=20)
g <- graph.adjacency(myAdjacencyMatrix,weighted=TRUE)
df <- get.data.frame(g)
head(df)
# from to weight
# 1 1 1 0.2655087
# 2 1 2 0.9347052
# 3 1 3 0.8209463
# 4 1 4 0.9128759
# 5 1 5 0.4346595
# 6 1 6 0.6547239
您需要使用
weighted=TRUE在调用 graph.adjacency(...)将权重分配给边缘。然后，get.data.frame(...)默认情况下将返回具有所有边属性的边的数据框。您可以使用 what=...要返回的参数，例如，具有属性的顶点列表。future :提供一个例子，而不是强制我们为你创造一个!!!
关于R igraph - 将加权邻接矩阵转换为加权边列表，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/24742882/