r - 如何用 R 绘制相配性？

Question

我在有关分类性(针对网络)的文献中找到了下图。我想用 R & igraph 以类似的方式绘制我的网络。 图上的每个点都对应一个网络边。在我的例子中，x 轴应代表源节点的度数，y 轴应代表目标节点的度数。我是 R 的初学者，因此如果有人能帮助我绘制这个图，我将非常感激。

我现在使用了 Vincent Zoonekynd 的代码并得到了下图。但我认为它仍然没有显示出完全正确的东西。轴上的节点应按其度数排序。当我查看该图时，我看到一些高度较高的节点围绕轴标记 42、100 或 175 放置。这没有多大意义。这里的排名过程有问题吗？

A <- get.adjacency(USAN_g_num)            
image(A,  ylim=c(0,627))             
i <- rank( degree(USAN_g_num), na.last=NA, ties.method="first" )
image(A[i,i], ylim=c(0,627)) 

(我在代码中添加了 ylim，以便低-低度和高-高度都在同一角的左下角和右上角绘制) 但我的图看起来应该与上面显示的不同，这是正确的，因为我的数据是不一致的。

Answer 1

它看起来像图的邻接矩阵， 节点按度数排序。

# Sample data
library(igraph)
library(Matrix)
g <- erdos.renyi.game(10, p=1/2) + erdos.renyi.game(10, p=1/2)

# Plot the adjacency matrix
A <- get.adjacency(g)
image(A)

# In this example, sorting the nodes by degree is not a good idea
i <- order( degree(g) )
image(A[i,i])