python - 有什么方法可以将 pythonappend 与 SWIG 的新内置功能一起使用?

标签 python numpy swig

我有一个与 SWIG 完美配合的小项目。特别是,我的一些函数返回 std::vectors,它们在 Python 中被翻译成元组。现在,我做了很多数字,所以我只是让 SWIG 在它们从 c++ 代码返回后将它们转换为 numpy 数组。为此,我在 SWIG 中使用了类似以下的内容。

%feature("pythonappend") My::Cool::Namespace::Data() const %{ if isinstance(val, tuple) : val = numpy.array(val) %}

(实际上,有几个名为 Data 的函数,其中一些返回 float ,这就是为什么我检查 val 实际上是一个元组的原因。)这很好用。

但是,我还想使用现在可用的 -builtin 标志。对这些 Data 函数的调用很少见,而且大多是交互式的,因此它们的速度很慢不是问题,但还有其他慢速循环可以通过内置选项显着加快。

问题在于,当我使用该标志时,pythonappend 功能会被忽略。现在,Data 再次返回一个元组。有什么办法我仍然可以返回 numpy 数组?我尝试使用类型映射,但结果变得一团糟。

编辑:

Borealid 很好地回答了这个问题。为了完整起见,我包含了一些我需要的相关但略有不同的类型映射,因为我通过 const 引用返回并且我使用向量的向量(不要开始!)。这些差异很大,我不希望其他人在试图找出细微差别时磕磕绊绊。

%typemap(out) std::vector<int>& {
  npy_intp result_size = $1->size();
  npy_intp dims[1] = { result_size };
  PyArrayObject* npy_arr = (PyArrayObject*)PyArray_SimpleNew(1, dims, NPY_INT);
  int* dat = (int*) PyArray_DATA(npy_arr);
  for (size_t i = 0; i < result_size; ++i) { dat[i] = (*$1)[i]; }
  $result = PyArray_Return(npy_arr);
}
%typemap(out) std::vector<std::vector<int> >& {
  npy_intp result_size = $1->size();
  npy_intp result_size2 = (result_size>0 ? (*$1)[0].size() : 0);
  npy_intp dims[2] = { result_size, result_size2 };
  PyArrayObject* npy_arr = (PyArrayObject*)PyArray_SimpleNew(2, dims, NPY_INT);
  int* dat = (int*) PyArray_DATA(npy_arr);
  for (size_t i = 0; i < result_size; ++i) { for (size_t j = 0; j < result_size2; ++j) { dat[i*result_size2+j] = (*$1)[i][j]; } }
  $result = PyArray_Return(npy_arr);
}

编辑 2:

虽然不是我想要的,但类似的问题也可以使用@MONK 的方法 (explained here) 来解决。

最佳答案

我同意你的看法,使用 typemap有点困惑,但这是完成这项任务的正确方法。你也是对的,SWIG 文档没有直接说 %pythonappend-builtin 不兼容,但强烈暗示:%pythonappend 添加到 Python 代理类,与 -builtin 一起使用的 Python 代理类根本不存在标志。

之前,您所做的是让 SWIG 转换 C++ std::vector对象转换成 Python 元组,然后将这些元组向下传递给 numpy - 他们再次被转换的地方。

您真正想要做的是在 C 级别将它们转换一次。

这里有一些代码可以将所有 std::vector<int>对象转换成 NumPy 整数数组:

%{
#include "numpy/arrayobject.h"
%}

%init %{
    import_array();
%}

%typemap(out) std::vector<int> {
    npy_intp result_size = $1.size();

    npy_intp dims[1] = { result_size };

    PyArrayObject* npy_arr = (PyArrayObject*)PyArray_SimpleNew(1, dims, NPY_INT);
    int* dat = (int*) PyArray_DATA(npy_arr);

    for (size_t i = 0; i < result_size; ++i) {
        dat[i] = $1[i];
    }

    $result = PyArray_Return(npy_arr);
}

这使用 C 级别的 numpy 函数来构造和返回一个数组。按顺序,它:

  • 确保 NumPy 的 arrayobject.h文件包含在 C++ 输出文件中
  • 原因 import_array在 Python 模块加载时调用(否则所有 NumPy 方法都会出现段错误)
  • 映射 std::vector<int> 的任何返回进入带有 typemap 的 NumPy 数组

这段代码应该放在之前%import包含返回 std::vector<int> 的函数的 header .除了这个限制之外,它是完全独立的,所以它不应该给你的代码库添加太多主观的“困惑”。

如果您需要其他矢量类型,您只需更改 NPY_INT和所有 int*int位,否则复制上面的函数。

关于python - 有什么方法可以将 pythonappend 与 SWIG 的新内置功能一起使用?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/9270052/

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