r - 将属性(性别)添加到边列表中的顶点

Question

我有一个生殖对的边缘列表，如下:

male_ID=c(1,2,3,4,5), female_ID=c(6,7,8,9,10), a=cbind(male_ID, female_ID)

使用 Igraph，我根据数据生成了一个图表，以对完整的 df 进行绘制和运行一些分析:

g <- graph_from_data_frame(a)

我的问题是，我现在可以根据边缘列表中列出的列，为个体的性别添加一个属性(给顶点着色)吗？

Answer 1

您可以为图形对象分配组标签。

为了创建组向量“性别”，您的数据框表明男性和女性的数量一样多。 graph_from_data_frame() 将 mal_ID 和 Female_ID 列堆叠在一起，您可以使用 igraph::V(g) 进行检查。因此，您可以从该信息中导出群向量:

male_ID=c(1,2,3,4,5); female_ID=c(6,7,8,9,10); a=cbind(male_ID, female_ID)

#create graph object from dataframe
g <- igraph::graph_from_data_frame(a)

#investigate structure g
igraph::V(g)
#[1] 1  2  3  4  5  6  7  8  9  10

# create sex group vector
sex <- c(replicate(length(male_ID), "Male"), replicate(length(female_ID), "Female"))

#Check group values
print(igraph::V(g)$group)
# NULL

#assign groups
igraph::V(g)$group <- sex

#Check group values again
print(igraph::V(g)$group)
#[1] "Male"   "Male"   "Male"   "Male"   "Male"   "Female" "Female" "Female" "Female" "Female"

# I use visnetwork to visualise 
vis_g <- visNetwork::toVisNetworkData(g, idToLabel = TRUE) 

visNetwork::visNetwork(
  nodes = vis_g$nodes,
  edges = vis_g$edges
  )