r - 如何使用 gml 格式文件将 igraph 边缘属性设置为字符串？

Question

我使用 GML 图形文件格式将图形读入 igraph(R 版本)。有没有办法将边缘属性设置为字符串？似乎某些属性标签允许具有字符串值，而其他属性标签则不允许。输入文件示例:

graph [
node [
    id 1
    control 1
    label "CiscoSW-1"
]
node [
    id 2
    control 1
    label "CiscoSW-z"
]
edge [
    source 1
    target 2
    difficulty 'A,B,C'
    label "CiscoSW-1"
]
]

Answer 1

似乎 read_graph 不喜欢单引号 ' '，因此您需要将它们换成双引号 "" >。

一种方法是读入文件，gsub删除有问题的引号，然后使用read_graph再次读入。因此，如果您的图形文件保存为 so.gml，则

# Read in file, `gsub` quotes and write to tempfile()
r <- gsub("[']", "\"", readLines("so.gml"))
cat(r, file=temp<-tempfile())

# Read amended gml file 
g <- read_graph(temp, format="gml")

检查边缘属性是否符合预期

edge.attributes(g)