这可能是 R 问题和算法问题的混合体。问题是关于一般的 OPTICS 和包“dbscan”中光学的 R 实现(https://cran.r-project.org/web/packages/dbscan/dbscan.pdf)
我从使用 DBSCAN 转向使用 OPTICS 的主要原因是我拥有的数据集具有可变密度簇，并且它们的形状不规则。 OPTICS 生成可达性图，但对于我的用例，更有趣的部分是集群的提取。原始论文中描述了一些自动聚类提取，而不仅仅是 eps 的单个切点。 (http://fogo.dbs.ifi.lmu.de/Publikationen/Papers/OPTICS.pdf)。
所以我的两部分 qn: 1)有没有办法通过这种方式使用R包进行自动提取？ 2) 是否有支持此功能的 OPTICS 实现(python，其他地方)？
最佳答案
1)是的! dbscan 包具有提取具有可变密度的光学簇的功能。 ?dbscan::extractXi()
extractXi extract clusters hiearchically specified in Ankerst et al (1999) based on the steepness of the reachability plot. One interpretation of the xi parameter is that it classifies clusters by change in relative cluster density. The used algorithm was originally contributed by the ELKI framework, but contains a set of fixes.
参见 https://cran.r-project.org/web/packages/dbscan/vignettes/dbscan.pdf用于方法和示例的广泛描述
关于r - 如何使用 OPTICS 提取簇(R 包 - dbscan 或替代方案)，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/33699514/