我是 Bioconductor 的新手,我正在尝试找到合适的软件包来做我想做的事情..这是给我一个 SwissProt ID 并给我基因符号,反之亦然。
套餐太多,不知道要哪个,谁能快点回答?
最佳答案
您可以采取的一种方法是使用有机体包:
library(org.Hs.eg.db)
假设我的基因符号就像这里键中的那些:
keys <- c("A1BG","A2M","A2MP1","NAT1","NAT2","AACP")
然后您可以只使用 select() 方法(这适用于 R-2.14 及更高版本)。
select(org.Hs.eg.db, cols=c("SYMBOL", "UNIPROT"), keys= keys, keytype="SYMBOL")
希望这对您有所帮助!
关于r - 从 Gene Symbol 获取 SwissProt ID,反之亦然,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/8013610/