r - 绘制不同类型的条形图ggplot

Question

我正在尝试绘制此 data 的条形图

目前我写的R脚本如下:

library(ggplot2)
f<-read.table("Coverage_test", sep="\t", header=TRUE)
f$Coverage <- factor(f$Coverage, levels=unique(as.character(f$Coverage)))
g = ggplot(data=f, aes(x=Coverage, y=Variable_counts, group=Form, fill=Type)) 
+ geom_bar(position="dodge", stat="identity", colour="black") 
+ facet_grid( ~ Sample_name, scales="free") + opts(title = "Coverage", axis.text.x = theme_text(angle = 90, hjust = 1, size = 8, colour = "grey50")) 
+ ylab("Number of variables") + scale_fill_hue() + scale_y_continuous(formatter="comma")
ggsave("Figure_test_coverage.pdf")

这段代码的输出如下:

我的问题是: 有没有办法显示基于两个变量的图形行为的差异。每个 x 轴变量都有四个条。我已经选择按“类型”填充颜色，这显示了不同的“类型”(一个变量)在我的数据中的行为。但我还想展示变量“Form”在我的数据中的行为方式。我已将它们分组在我的代码“group=Form”中，但无法在实际图表中(视觉上)区分它们。这可以在线图中通过为一个变量显示不同的颜色和为另一个变量显示不同的线型(实线和虚线)来完成。像下面这样的东西: .

我想知道“表单”变量是否可以用不同的颜色显示，或者至少可以在各自的条形下方命名，或者任何可能的名称？ 非常感谢任何帮助。

谢谢。

Answer 1

我想你想要这样的东西:

ggplot(data=dat, aes(x=Coverage, 
                        y=Variable_counts, 
                         group=interaction(Form,Type), 
                         fill=interaction(Form,Type))) +
 geom_bar(position="dodge", stat="identity", colour="black")

编辑

由于条形图和 samrt 公式表示法，我在这里使用格子。为了好玩，我使用了一个类似 ggplot 的主题，使用 latticeExtra。

library(latticeExtra)
barchart(Variable_counts~Coverage|Sample_name,
         groups=interaction(Type,Form),
         data=dat,stack=F,auto.key=list(columns = 4),
         par.settings = ggplot2like(),
         axis = axis.grid,
         between=list(x=2))