我正在迭代一个文件,并试图确定是否在我创建的空列表中找到了一组特定的 3 个项目(来自文件);如果没有,我想附上它们。如果它们已经出现,我想跳过它们。
但是,当我运行以下代码时:
from pprint import pprint as pp
targets = open(file)
longest_UTR = []
counter = 0
for line in targets:
(chromosome, locus, mir, gene, transcript, UTR_length) = line.strip("\n").split("\t")
if [locus, mir, gene] not in longest_UTR:
longest_UTR.append([locus, mir, gene, transcript, UTR_length])
counter += 1
if counter == 100:
break
pp (longest_UTR)
我发现输出包含重复项,即它没有跳过该组项目,即使它们出现在空列表中(如下面的箭头所示)。
['CFI', 'hsa-miR-576-5p', 'DIS3', 'ENST00000490646', '2934'],
['APOE', 'hsa-miR-642a-5p', 'WDR64', 'ENST00000425826', '2122'],
>['C2/CFB/SKIV2L', 'hsa-miR-219a-1-3p', 'GLG1', 'ENST00000422840', '4748'],
['C2/CFB/SKIV2L', 'hsa-miR-219a-1-3p', 'GLG1', 'ENST00000422840', '4748']<,
['APOE', 'hsa-miR-330-3p', 'DCAF4L1', 'ENST00000333141', '4764'],
['TMEM97/VTN', 'hsa-miR-144-3p', 'DCAF4L1', 'ENST00000333141', '4764']]
我想要一些关于为什么会出现这种情况的指导。谢谢。
最佳答案
列表不可散列,因此不能按照您想象的方式比较两者之间的相等性。列表比较可以使用sets来完成反而。
从 pprint 导入 pprint 作为 pp
targets = open(file)
longest_UTR = []
for line in targets:
chromosome, locus, mir, gene, transcript, UTR_length = line.strip("\n").split("\t")
if not [set([locus, mir, gene]) < set(utr) for utr in longest_UTR]:
longest_UTR.append([locus, mir, gene, transcript, UTR_length)])
pp (longest_UTR)
关于python - 如何搜索项目集合是否在列表中?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/53101449/