python - 交易nii.gz时如何避免大数据问题？

Question

我有 nii.gz 文件的数据集，每个文件大约 1G ，包括 4d 张量。据我所知，有两种阅读它们的方法:

img = nib.load('fMRI.nii.gz')
imgarr = np.array(img.dataobj)

或

img = nib.load('fMRI.nii.gz')
imgarr = img.get_data()

问题是读取整个张量很昂贵，而我只需要一个切片。还有其他办法吗？

Answer 1

实际上，您不需要将主图像数据的任何内容加载到内存中。

img = nib.load('fMRI.nii.gz')
 
# get the first 10 slices
img.slicer[0:10]

#verify selection
img.slicer[0:10].shape