python - 在没有实际作业文件的情况下提交 qsub 作业的语法？

Question

我想在不创建离散作业文件的情况下即时提交 qsub 作业。所以，假设我有一个名为“get_time.py”的 python 脚本，它只报告时间。而不是像这样制作提交脚本:

cat>job.sub<<eof
    #PBS -l walltime=1:00:00
    cd $PBS_O_WORKDIR
    get_time.py
eof

...然后提交作业:qsub job.sub

我希望能够绕过文件创建步骤，并且我认为构造应该是这样的: qsub -d。 -e get_time.py

其中 -e 是我虚构的参数，它告诉 qsub 以下是要发送到调度程序的代码，而不是使用离散的提交文件。

我疯了吗？似乎应该已经有一个简单的解决方案，但我在任何地方都找不到。感谢您的任何建议!

Answer 1

如果您可以在 HERE 文档中编写您的工作，如您的示例所示，您可以将该 HERE 文档直接传递给 qsub 而无需临时文件:

qsub <<eof
    #PBS -l walltime=1:00:00
    cd \$PBS_O_WORKDIR
    get_time.py
eof

另请注意，您需要在 $PBS_O_WORKDIR 中对美元符号进行转义，否则它将在提交作业之前被插入并最终成为空字符串。