r - 通过 bash 文件在本地编译 R 时出错

Question

我正在尝试使用 bash 文件在本地编译 R，但失败并显示以下错误:

tar: command not found
cd: R-3.2.5: No such file or directory
./configure: No such file or directory
make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.
make: *** No rule to make target `install'.  Stop.
R-3.2.5/lib64/R/bin/R: No such file or directory
sed: command not found
mv: command not found
tar: command not found

下面是我提交的 bash 文件:

#!/bin/bash
tar -xzvf R-3.2.5.tar.gz
cd R-3.2.5
./configure --prefix=$(pwd)
make
make install
cd ..
R-3.2.5/lib64/R/bin/R -e 'install.packages(c("BGLR"), 
repos="http://cran.cnr.berkeley.edu/", dependencies = TRUE)'
sed -i '/^R_HOME_DIR=/c R_HOME_DIR=$(pwd)/R' R-3.2.5/lib64/R/bin/R
mv R-3.2.5/lib64/R ./
tar -czvf R.tar.gz R/

当我直接在终端上运行相同的命令行时它工作正常，但是当我尝试使用 bash 文件运行它们时它失败了。

有人知道如何让它发挥作用吗？

Answer 1

用于运行脚本的 bash 实例似乎没有正确设置 $PATH 变量，因此找不到 tar 和其他命令。

尝试用 #!/bin/bash -l 替换第一行。添加 echo Path: $PATH 作为第 2 行并查看列出的目录之一是否实际包含 tar。你应该得到像 /bin:/sbin:/usr/bin/ 这样的东西。