c - 将 GSL 库链接到 Matlab MEX 时如何修复 'unknown type name' 错误

Question

我目前正在尝试优化我在 MATLAB(版本 R2019a)中处理的一些代码。为了计算我的结果，MATLAB 必须多次计算某个函数，这会减慢一切。因此，我认为用 C 编写此函数并将其导入 MATLAB 会大大加快速度。不幸的是，我在尝试使用 MEX 将 C 代码编译到 MATLAB 中时遇到了一些麻烦。

我以前用过C，但肯定不是专家。无论如何，我已经在 C 中测试了代码并且它可以工作，问题在于尝试在 MATLAB 中编译代码。我正在使用 GNU 科学库 (GSL)，因此应该在 MATLAB 中使用 MEX 编译库。

以下是导致相同问题和错误的最小工作示例。 C 代码看起来像这样，保存在 MWE.c

#include "mex.h" // The mex library
#include <gsl/gsl_sf_bessel.h> // GSL function

// Define some function, in my case this is somewhat more complicated
double bessel_fun (double *x)
{
    return gsl_sf_bessel_J0 (*x);
}

// MEX function needed for compiling in MATLAB
void mexFunction( int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[])
{
    //declare variables
    mxArray *x_M, *y_M;
    double *x, *y;

    //associate inputs
    x_M = mxDuplicateArray(prhs[0]);

    //associate outputs
    y_M = plhs[0] = mxCreateDoubleMatrix(1,1,mxREAL);

    // Access variables
    x = mxGetPr(x_M);
    y = mxGetPr(y_M);

    // Save the result in the output variable
    y[0]=bessel_fun(x);
}

然后我使用 MATLAB 编译

    mex -IC:/MinGW/include -LC:/MinGW/lib -lgsl -lgslcblas MWE.c

MATLAB 没有编译(如果我使用不包含任何库的 C 代码 确实有效)，MATLAB 会返回很多错误，如下所示:

Error using mex
In file included from
C:/ProgramData/MATLAB/SupportPackages/R2019a/3P.instrset/mingw_w64.instrset/x86_64-w64-mingw32/include/stddef.h:7:0,
                 from
C:/ProgramData/MATLAB/SupportPackages/R2019a/3P.instrset/mingw_w64.instrset/lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/6.3.0/include/stddef.h:1,
                 from C:\MinGW\include/stdio.h:68,
                 from C:\Program Files\MATLAB\R2019a/extern/include/mex.h:38,
                 from C:\userpath\MWE.c:1:
C:/ProgramData/MATLAB/SupportPackages/R2019a/3P.instrset/mingw_w64.instrset/x86_64-w64-mingw32/include/crtdefs.h:35:19:
error: expected '=', ',', ';', 'asm' or '__attribute__' before 'typedef'
 __MINGW_EXTENSION typedef unsigned __int64 size_t;
                   ^~~~~~~
C:/ProgramData/MATLAB/SupportPackages/R2019a/3P.instrset/mingw_w64.instrset/x86_64-w64-mingw32/include/crtdefs.h:45:19:
error: expected '=', ',', ';', 'asm' or '__attribute__' before 'typedef'
 __MINGW_EXTENSION typedef __int64 ssize_t;
                   ^~~~~~~
C:/ProgramData/MATLAB/SupportPackages/R2019a/3P.instrset/mingw_w64.instrset/x86_64-w64-mingw32/include/crtdefs.h:52:9:
error: unknown type name 'size_t'
 typedef size_t rsize_t;

[...]

并且在不同的类型名称上出现相同的错误。

有谁知道在 MATLAB 中使用 MEX 进行编译时如何正确包含库？

Answer 1

明白了。您能否尝试以下操作:

mex -U__MINGW_EXTENSION -IC:/MinGW/include -LC:/MinGW/lib -lgsl -lgslcblas MWE.c