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我在生物信息学方面做过几项研究工作,并使用 Matlab 进行研究。 Matlab 有很多强大的工具并且易于使用。我确实考虑过基因组测序和预测代谢途径。我想知道其他人认为什么是最好的?或者可能不是一种特定的语言,而是几种最适合数学繁重且处理大量数据的生物信息学工作。
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我在生物信息学方面做过几项研究工作,并使用 Matlab 进行研究。 Matlab 有很多强大的工具并且易于使用。我确实考虑过基因组测序和预测代谢途径。我想知道其他人认为什么是最好的?或者可能不是一种特定的语言,而是几种最适合数学繁重且处理大量数据的生物信息学工作。
最佳答案
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对于我们大多数生物信息学家来说,这包括 Python、R、Perl 和 bash 命令行实用程序(如 sed、awk、cut、sort 等)。还有一些人使用 Java、Ruby、C++ 和 Matlab 编写代码。
那么底线是什么?无论哪种语言让您最轻松地完成工作,都是适合您的语言。回答这个问题应该包括仔细调查您可以从中提取的库和其他代码,以及有关您自己的偏好和经验的信息。如果您正在进行微阵列分析,很难击败 R/bioconductor 库,但对于处理大多数类型的大型测序数据集的人来说,这绝对是错误的语言。
关于matlab - 您认为生物信息学的最佳语言是什么?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/2994109/