python - 线性回归在 Python 中失败,因变量中的值很大

标签 python r pandas stata linear-regression

我正在尝试使用 Python(使用 pandas.stats.api.ols)重写一个预测模型(在 Stata 中),并遇到了线性回归问题:pandas 与 Stata 中的不匹配。

调查表明,根本原因可能是依赖值的值非常大。基于以下发现,我有这种怀疑:

1) 我在 Python 中创建了一个简单的 DataFrame 并用它运行了线性回归:

from pandas.stats.api import ols
import pandas as pd
df = pd.DataFrame({"A": [10,20,30,40,50,21], "B": [20, 30, 10, 40, 50,98], "C": [32, 234, 23, 23, 31,21], "D":[12,28,12,98,51,87], "E": [1,8,12,9,12,91]})
ols(y=df['A'], x=df[['B','C', 'D', 'E']])

LR 的总结是:

-------------------------Summary of Regression Analysis-------------------------

Formula: Y ~ <B> + <C> + <D> + <E> + <intercept>

Number of Observations:         6
Number of Degrees of Freedom:   5

R-squared:         0.4627
Adj R-squared:    -1.6865

Rmse:             23.9493

F-stat (4, 1):     0.2153, p-value:     0.9026

Degrees of Freedom: model 4, resid 1

-----------------------Summary of Estimated Coefficients------------------------
      Variable       Coef    Std Err     t-stat    p-value    CI 2.5%   CI 97.5%
--------------------------------------------------------------------------------
             B     0.3212     1.1176       0.29     0.8218    -1.8693     2.5117
             C    -0.0488     0.1361      -0.36     0.7806    -0.3155     0.2178
             D     0.1512     0.4893       0.31     0.8092    -0.8077     1.1101
             E    -0.4508     0.8268      -0.55     0.6822    -2.0713     1.1697
     intercept    20.9222    23.6280       0.89     0.5386   -25.3887    67.2331
---------------------------------End of Summary---------------------------------

我将这个 DataFrame 保存到一个 Stata .dta 文件中,然后在 Stata 中运行 LR:

 use "/tmp/lr.dta", clear
 reg A B C D E

结果是一样的:

      Source |       SS       df       MS              Number of obs =       6
-------------+------------------------------           F(  4,     1) =    0.22
       Model |  493.929019     4  123.482255           Prob > F      =  0.9026
    Residual |  573.570981     1  573.570981           R-squared     =  0.4627
-------------+------------------------------           Adj R-squared = -1.6865
       Total |      1067.5     5       213.5           Root MSE      =  23.949

------------------------------------------------------------------------------
           A |      Coef.   Std. Err.      t    P>|t|     [95% Conf. Interval]
-------------+----------------------------------------------------------------
           B |   .3211939   1.117591     0.29   0.822    -13.87914    14.52153
           C |  -.0488429   .1360552    -0.36   0.781    -1.777589    1.679903
           D |   .1512067   .4892539     0.31   0.809    -6.065353    6.367766
           E |  -.4508122   .8267897    -0.55   0.682    -10.95617    10.05455
       _cons |    20.9222   23.62799     0.89   0.539    -279.2998    321.1442
------------------------------------------------------------------------------

我在 R 中试过了,得到了相同的结果。

2) 但是,如果我在 Python 中增加因变量的值:

df = pd.DataFrame({"A": [10.0,20.0,30.0,40.0,50.0,21.0]})
df['B'] = pow(df['A'], 30)
df['C'] = pow(df['A'], 5)
df['D'] = pow(df['A'], 15)
df['E'] = pow(df['A'], 25)

我已确保所有列都在此处使用 float64: df.dtypes 一个 float64 B float64 C float64 D float64 E float64 dtype: 对象

我得到的结果是:

-------------------------Summary of Regression Analysis-------------------------

Formula: Y ~ <B> + <C> + <D> + <E> + <intercept>

Number of Observations:         6
Number of Degrees of Freedom:   2

R-squared:        -0.7223
Adj R-squared:    -1.1528

Rmse:             21.4390

F-stat (4, 4):    -1.6775, p-value:     1.0000

Degrees of Freedom: model 1, resid 4

-----------------------Summary of Estimated Coefficients------------------------
      Variable       Coef    Std Err     t-stat    p-value    CI 2.5%   CI 97.5%
--------------------------------------------------------------------------------
             B    -0.0000     0.0000      -0.00     0.9973    -0.0000     0.0000
             C     0.0000     0.0000       0.00     1.0000    -0.0000     0.0000
             D     0.0000     0.0000       0.00     1.0000    -0.0000     0.0000
             E     0.0000     0.0000       0.00     0.9975    -0.0000     0.0000
     intercept     0.0000    21.7485       0.00     1.0000   -42.6271    42.6271
---------------------------------End of Summary---------------------------------

但在 Stata 中,我得到了截然不同的结果:

      Source |       SS       df       MS              Number of obs =       6
-------------+------------------------------           F(  4,     1) =  237.35
       Model |  1066.37679     4  266.594196           Prob > F      =  0.0486
    Residual |   1.1232144     1   1.1232144           R-squared     =  0.9989
-------------+------------------------------           Adj R-squared =  0.9947
       Total |      1067.5     5       213.5           Root MSE      =  1.0598

------------------------------------------------------------------------------
           A |      Coef.   Std. Err.      t    P>|t|     [95% Conf. Interval]
-------------+----------------------------------------------------------------
           B |  -1.45e-45   2.32e-46    -6.24   0.101    -4.40e-45    1.50e-45
           C |   2.94e-06   3.67e-07     8.01   0.079    -1.72e-06    7.61e-06
           D |  -3.86e-21   6.11e-22    -6.31   0.100    -1.16e-20    3.90e-21
           E |   4.92e-37   7.88e-38     6.24   0.101    -5.09e-37    1.49e-36
       _cons |   9.881129    1.07512     9.19   0.069    -3.779564    23.54182
------------------------------------------------------------------------------

R 中的结果与 Stata 一致: lm(公式=A~B+C+D+E,数据=stata)

Residuals:
         1          2          3          4          5          6 
-1.757e-01  8.211e-01  1.287e-03 -1.269e-06  1.289e-09 -6.467e-01 

Coefficients:
              Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)  
(Intercept)  9.881e+00  1.075e+00   9.191    0.069 .
B           -1.449e-45  2.322e-46  -6.238    0.101  
C            2.945e-06  3.674e-07   8.015    0.079 .
D           -3.855e-21  6.106e-22  -6.313    0.100  
E            4.919e-37  7.879e-38   6.243    0.101  
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

Residual standard error: 1.06 on 1 degrees of freedom
Multiple R-squared:  0.9989,  Adjusted R-squared:  0.9947 
F-statistic: 237.3 on 4 and 1 DF,  p-value: 0.04864

因此,在我看来,pandas 在这里遇到了一些问题。有谁能帮忙出出主意吗?

最佳答案

我认为这是因为 python 中的相对精度问题(不仅在 python 中,还有大多数其他编程语言,如 C++)。 np.finfo(float).eps给出 2.2204460492503131e-16 , 所以一切都小于 eps*max_value_of_your_data本质上将被视为 0当你尝试像 + - * / 这样的原始操作时.例如,1e117 + 1e100 == 1e117返回 True ,因为 1e100/1e117 = 1e-17 < eps .现在查看您的数据。

# your data
# =======================
print(df)

    A           B          C           D           E
0  10  1.0000e+30     100000  1.0000e+15  1.0000e+25
1  20  1.0737e+39    3200000  3.2768e+19  3.3554e+32
2  30  2.0589e+44   24300000  1.4349e+22  8.4729e+36
3  40  1.1529e+48  102400000  1.0737e+24  1.1259e+40
4  50  9.3132e+50  312500000  3.0518e+25  2.9802e+42
5  21  4.6407e+39    4084101  6.8122e+19  1.1363e+33

当考虑相对精度时,

# ===================================================
import numpy as np

np.finfo(float).eps # 2.2204460492503131e-16

df[df < df.max().max()*np.finfo(float).eps] = 0
df

   A           B  C  D           E
0  0  0.0000e+00  0  0  0.0000e+00
1  0  1.0737e+39  0  0  0.0000e+00
2  0  2.0589e+44  0  0  8.4729e+36
3  0  1.1529e+48  0  0  1.1259e+40
4  0  9.3132e+50  0  0  2.9802e+42
5  0  4.6407e+39  0  0  0.0000e+00

因此 y(A) 完全没有变化,这就是为什么 statsmodels返回所有 0 系数。提醒一下,在运行回归之前先规范化数据始终是一个好习惯。

关于python - 线性回归在 Python 中失败,因变量中的值很大,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/31488212/

相关文章:

python - 为什么 [1].append(2) 评估为 None 而不是 [1,2]?

python - 如何在 Django 的表单文件字段中指定 "upload to"路径?

r - 分层抽样似乎不会改变 randomForest 结果

r - 使用 ggplot2 R 在背景中显示火山绘图点,其颜色高于其他绘图点

python - Pandas 中的条件词频计数

重新安装 R linux ubuntu : unmet dependencies R

python-3.x - 在将Pandas数据帧插入BigQuery表中的同时处理NaN值

python - 如何用 pandas 将大表保存为图像

python - 是否可以在 Pandas 因式分解方法中指定级别的顺序?

python - 计算k-means的方差百分比?