bash - 更改 xargs(或 GNU Parallel)参数中的文本

Question

我有一个程序，可以通过两种方式运行:单端或成对端模式。语法如下:

program <output-directory-name> <input1> [input2]

其中需要输出目录和至少一个输入。如果我想在三个文件(例如示例 A、B 和 C)上运行此命令，我会使用类似 find 和 xargs 或并行的方法:

user@host:~/single$ ls
sampleA.txt  sampleB.txt  sampleC.txt

user@host:~/single$ find . -name "sample*" | xargs -i echo program {}-out {}
program ./sampleA.txt-out ./sampleA.txt
program ./sampleB.txt-out ./sampleB.txt
program ./sampleC.txt-out ./sampleC.txt

user@host:~/single$ find . -name "sample*" | parallel --dry-run program {}-out {}
program ./sampleA.txt-out ./sampleA.txt
program ./sampleB.txt-out ./sampleB.txt
program ./sampleC.txt-out ./sampleC.txt

但是当我想以“paired-end”模式运行程序时，我需要给它两个输入。这些是相关文件，但它们不能简单地连接起来 - 您必须以这两个文件作为输入来运行程序。文件的命名合理，例如sampleA_1.txt 和sampleA_2.txt。

我希望能够使用 xargs(或最好是并行)之类的东西在命令行上轻松创建它:

user@host:~/paired$ ls
sampleA_1.txt  sampleB_1.txt  sampleC_1.txt
sampleA_2.txt  sampleB_2.txt  sampleC_2.txt

user@host:~/paired$ find . -name "sample*_1.txt" | sed/awk? | parallel ?
program ./sampleA-out ./sampleA_1.txt ./sampleA_2.txt
program ./sampleB-out ./sampleB_1.txt ./sampleB_2.txt
program ./sampleC-out ./sampleC_1.txt ./sampleC_2.txt

理想情况下，该命令会删除 _1.txt 以创建输出目录名称(sampleA-out 等)，但我确实需要能够采用该参数并将第二个输入的 _1 更改为 _2 .

我知道这对于脚本来说非常简单 - 我在 Perl 中使用快速正则表达式替换来完成此操作。但我希望能够通过快速的一句台词来做到这一点。

提前致谢。

Answer 1

I did this in Perl with a quick regular expression substitution. But I would love to be able to do this with a quick one-liner.

Perl 也有单行语句，就像 sed 和 awk 一样。你可以写:

find . -name "sample*_1.txt" | perl -pe 's/_1\.txt$//' | parallel program {}-out {}_1.txt {}_2.txt

(-e 标志表示“下一个参数是程序文本”；-p 标志表示“程序应循环运行；对于每一行输入，将 $_ 设置为该行，然后运行程序，然后打印 $_"。)