arrays - 将多维数组转换为因子数据框

Question

我有一个来自tapply函数的结果，该函数创建一个数组(包含模块名称、动物名称(行)和测试天(列))，如下所示

,, module1
     [,D1] [,D2] [,D3] [,D4]
[A1,]    1    3    2    1
[A2,]    2    1    3    2

,, module3
     [,D1] [,D2] [,D3] [,D4]
[A1,]    1    3    2    1
[A2,]    2    1    3    2

,, module3
     [,D1] [,D2] [,D3] [,D4]
[A1,]    1    3    2    1
[A2,]    2    1    3    2

我想将其转换为一个数据框架，其中模块名称和维度名称是数据框架中的因素，如下所示:

Module1  D1  A1  1
Module1  D1  A2  2 
Module1  
..
Module3  D4  A1  1
Module3  D4  A2  2
etc

然后我可以将其用于 ggplot 和其他函数。 是否有一个封装/函数可以让我做到这一点？

Answer 1

这是使用 plyr 和 reshape2 的一种方法:

adply(a, 3, function(x) melt(cbind(names=rownames(x), as.data.frame(x))))
#         X1 names variable value
# 1  module1    A1       D1     1
# 2  module1    A2       D1     2
# 3  module1    A1       D2     3
# 4  module1    A2       D2     1
# 5  module1    A1       D3     2
# 6  module1    A2       D3     3
# 7  module1    A1       D4     1
# 8  module1    A2       D4     2
# 9  module2    A1       D1     1
# 10 module2    A2       D1     2
# 11 module2    A1       D2     3
# 12 module2    A2       D2     1
# 13 module2    A1       D3     2
# 14 module2    A2       D3     3
# 15 module2    A1       D4     1
# 16 module2    A2       D4     2
# 17 module3    A1       D1     1
# 18 module3    A2       D1     2
# 19 module3    A1       D2     3
# 20 module3    A2       D2     1
# 21 module3    A1       D3     2
# 22 module3    A2       D3     3
# 23 module3    A1       D4     1
# 24 module3    A2       D4     2