R 不再并行运行

Question

我运行 (k)Ubuntu 12.04.2 和 R 3.0.1

我写了一堆以前可以并行运行的代码，但现在不再并行了。甚至不再并行运行:

library(doMC)
registerDoMC(4)
Results = foreach (i = 1:1e6, .combine = "c") %dopar% {
  sqrt(i)
}

这绝对应该。我认为破坏它的是 R 3.0.1 更新或我安装的 -dev, -devel BLAS 软件包。 (我认为是 openBLAS)

我已经按照其他地方的建议尝试了 system(sprintf("taskset -p 0xffffffff %d", Sys.getpid())) ，并得到了这个结果:

pid 2415's current affinity mask: 1
pid 2415's new affinity mask: f

我还尝试过运行 R:

taskset 0xffff R

但是，在执行上述任一步骤后，运行循环仍然仅使用一个核心。

我想要并行处理回来!我怎样才能得到它？

Answer 1

我找到了解决办法!讽刺的是，为了恢复并行处理，我必须同时执行我在问题中提到的两个步骤

所以，从 R 开始

taskset 0xffff R

然后运行

system(sprintf("taskset -p 0xffffffff %d", Sys.getpid()))

R 内。

瞧，并行处理返回