r - R中使用foreach时是否导入 "parallel"包

Question

我正在使用foreach() foreach 中的函数用于并行计算的 R 包。除了这个功能之外，我认为还需要使用 registerDoMC() doMC 中的函数包裹。

但是，当我写下我的DESCRIPTION时文件，Imports部分包含 doMC (>= 1.3.0), foreach (>= 1.4.1) ，但是当我运行代码时，出现错误指示: 找不到 iter功能。于是，我也import iterators包裹。

看来还是有错误:mclapply()函数由 foreach() 使用，并且此函数出现在 parallel 的两者中和 multicore包裹。我将这两个包都包含在 Imports 中部分，但是当我运行 search() 时，出现警告:

Warning messages:
1: replacing previous import ‘mclapply’ when loading ‘parallel’ 
2: replacing previous import ‘mcparallel’ when loading ‘parallel’ 
3: replacing previous import ‘pvec’ when loading ‘parallel’ 

这很奇怪:尽管我明确地 imports iterators 的两个包和multicore ，在加载我自己的包后我仍然无法使用它们的功能...相反，我必须显式运行:

library(iterators)
library(multicore)

为了在我的包中使用我自己的函数，该函数利用并行计算。我的包裹写的有问题吗？非常感谢!

Answer 1

如果您通过将 doMC 添加到“Depends”来修改您的描述文件，那么“找不到 iter 函数”错误就会消失，并且来自 foreach 的函数、 iterators 和 doMC 将在您的包加载时可用，这似乎是您的偏好。第一章Writing R Extensions讨论“导入”和“依赖”之间的区别。一般来说，最好使用“导入”以避免强制包的用户加载仅在包内需要的包，但它有用途。

实际上，您看到的“找不到 iter 函数”错误是由 doMC 包中的错误引起的，使用“Depends”而不是“Imports”可以解决此错误。您的包应该只需要导入它直接使用的包，因此如果您没有显式调用 iter 或 mclapply，则不必导入 迭代器、并行或多核。由于 parallel 包含了 multicore，因此您永远不应该同时导入 parallel 和 multicore，这样应该避免出现警告消息你看到的。

我向软件包维护者提交了 doMC 错误的修复程序，因此您应该能够将 foreach 和 doMC 导入到软件包中，而无需包的下一版本中出现错误。