r - 可以交互使用包，但 Rscript 给出错误

Question

我在 R 中使用“topicmodels”包。一切都可以交互地正常工作，但如果我使用 Rscript 运行完全相同的命令，则会出现错误。

第一个错误(我已解决)是 R 不知道 is() 函数是什么。我通过导入“methods”包解决了这个问题。显然，即使交互式 R 会自动导入，Rscript 也不会自动导入它，这导致了 is() 的问题。问题解决了。

但是，我现在陷入了另一个错误，我无法弄清楚。我正在使用 "topicmodels" 包中的 LDA() 函数，使用数据(DTM 格式)和 k=10。我这样调用它:

library(plyr)
library(lda)
library(topicmodels)
x = as.data.frame(sapply(1:100, function(x) sample(1:100,100,replace=T)))
u = llply(colnames(x), function(a) rbind(0:(length(x[,a])-1),x[,a]))
v = rownames(x)
y = ldaformat2dtm(u, v)
a = LDA(x, 10)

它给了我以下错误:

> Error in as(control, "LDA_VEMcontrol") :
>   no method or default for coercing "NULL" to "LDA_VEMcontrol"
> Calls: LDA -> method -> as
> Execution halted

最主要的是它可以交互方式工作，但不使用Rscript。我知道数据的格式正确，如果我打印数据，它看起来不错。我还缺少其他东西吗？是否有其他模块 Rscript 不加载，但 R Interactive 加载？谢谢!

Answer 1

我刚刚在交互式 session 中通过 Rscript 和 source() 运行了该示例，两者都有效。 Rscript 的唯一输出是:

% Rscript /tmp/sc.r
Loading required package: methods

所以它似乎已经自己解决了methods问题。

我有 R 3.0.1，也许你有旧版本的 R 或其中一个软件包？他们可能已更新其先决条件列表以包含方法。