r - 将位向量写入R中最小大小的文件中

Question

我有一个非常大的 boolean 向量(例如 a=c(TRUE, TRUE,FALSE, FALSE) 但更大)，并且希望将其存储在尽可能紧凑的文件中。最简单的方法是什么？

谢谢

Answer 1

作为linked question建议，使用 saveRDS 将生成的文件保存为二进制 rds 文件是最佳选择，前提是您只想将生成的文件与 R 一起使用，而不是任何其他程序。

如果您的向量没有任何缺失值，您可以将逻辑向量转换为位向量，这会占用一半的磁盘空间。 (它在工作区中使用的内存也更少。)

library(bit)
x <- runif(1e6) > 0.5
x2 <- as.bit(x)
saveRDS(x, "x.rds")    # takes up 246kb
saveRDS(x2, "x2.rds")  # takes up 123kb

如果您需要在其他程序中重用该变量，请选择该程序可以读取的格式! HDF5 是一种常见的紧凑格式，可能适合。