r - 创建对多个连续变量执行 ttest 的函数时出错

Question

因此，我尝试创建一个函数，该函数将接受一串连续变量、一个分类变量和一个数据帧，并输出一个表，其中包含每个连续变量:均值 group1、均值 group2、teststat、置信区间，p 值。

当前这里给出的错误是: model.frame.default(formula = var ~ class, data = data) 中的错误:变量长度不同(为“class”找到)

我希望得到有关如何修复此错误并让此函数执行我喜欢的操作的任何反馈。我想让这个函数更加充实和灵活，但我什至无法让基本版本(处理多个变量)工作。

谢谢!

#Continuous must be an object of the form:
   #vars<-c("cont1", "cont2", "cont3", etc)
#CREATE DATA
cat1<-sample(c(1,2), 100, replace=T)
cont1<-rnorm(100, 25, 8)
cont2<-rnorm(100, 0, 1)
cont3<-rnorm(100, 6, 14.23)
cont4<-rnorm(100, 25, 8)*runif(5, 0.1, 1)
one<-data.frame(cat1, cont1, cont2, cont3, cont4)

#FUNCTION
two.group.comp<-function(continvars,class,data){
attach(data)

descriptives<-function(var){
 test<-t.test(var~class, data)
 means<-data.frame(test[5])
 mean1<-means[1,1]
 mean2<-means[2,1]
 teststatbig<-data.frame(test[1])
 teststat<-teststatbig[1,1]
 conf<-data.frame(test[4])
 lconf<-conf[1,1]
 uconf<-conf[2,1]
 pvalues<-data.frame(test[3])
 pvalue<-pvalues[1,1]

 variablename<-deparse(substitute(var))

 entry<-data.frame(variablename,mean1,mean2,lconf,uconf,teststat,pvalue)
 }  
 var<-data.frame(continvars)
 table<<-sapply(var,descriptives)
  detach(data)
}  
#VARIABLES
continvars<-c("cont1", "cont2", "cont3")
#CALL TO FUNCTION
two.group.comp(continvars=continvars, class=cat1, data=one)

Answer 1

这符合你的要求吗？

two.group.comp <- function(continvars,class,data){
  get.stats <- function(x,cat){
    f  <- unique(cat)
    x1 <- x[cat==f[1]]
    x2 <- x[cat==f[2]]
    tt <- t.test(x1,x2)
    smry        <- c(tt$estimate,tt$statistic,p=tt$p.value)
    names(smry) <- c("mean.1","mean.2","t","p")
    return(smry)
  }
  result <- do.call(rbind,lapply(data[,continvars],get.stats,cat=class))
  return(result)
}
# create sample dataset
set.seed(1)
cat1 <-sample(c(1,2), 100, replace=T)
cont1<-rnorm(100, 25, 8)
cont2<-rnorm(100, 0, 1)
cont3<-rnorm(100, 6, 14.23)
cont4<-rnorm(100, 25, 8)*runif(5, 0.1, 1)
one  <-data.frame(cat1, cont1, cont2, cont3, cont4)
continvars<-c("cont1", "cont2", "cont3")
# call the function...
two.group.comp(continvars,cat1,one)
#           mean.1      mean.2          t          p
# cont1 24.4223859 25.33275704 -0.6024497 0.54827955
# cont2  0.0330148  0.01168979  0.1013519 0.91947827
# cont3 10.5784201  4.00651493  2.4183031 0.01747468

从内到外工作:

1. get.stats(...) 获取单列 data，将其拆分为 x1 和 x2 根据 cat，运行 t 检验，并以命名向量的形式返回汇总统计信息。
2. lapply(...) 将 data 的 continvars 列传递给 get.stats(...) 一次一个。
3. do.call(rbind,...) 将 lapply(...) 返回的向量集按行绑定(bind)在一起，生成最终的向量结果表。

如果您传递列号而不是列名称，这也将起作用。

一条建议:按照您的设置方式，您传递连续变量的列名称，但将分组因子作为向量传递。如果传递分组因子的列名会更清晰。