r - R 中的 GSL 库 - 未找到符号

Question

作为新用户，我对 C 的了解非常有限，我有一些用 C 编写的代码需要在 R 中使用。我尝试使用“gsl_integration”库。由于代码需要传递给可能未安装 GSL 库的不同人员，因此我创建了“integration.h”文件，其中包含“gsl_integration”库中的所有函数和依赖项。我可以使用

编译我的 code.c 文件

$ R CMD SHLIB code.c

这是我得到的输出

 -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG  
-I/usr/local/include -I/usr/local/include/freetype2 -I/opt/X11/include
-fPIC  -Wall -mtune=core2 -g -O2  -c code.c -o code.o
clang -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined
 dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress 
-L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o code.so code.o 
-F/Library/Frameworks/R.framework/.. 
-framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation

当我尝试在 R 中 dyn.load“code.so”文件时，出现以下错误

Error in dyn.load("code.so") : 
  unable to load shared object '/Users/Thodoris/Desktop/Int_C/code.so':
  dlopen(/Users/Thodoris/Desktop/Int_C/code.so, 6): Symbol not found: _gsl_integration_qags
  Referenced from: /Users/Thodoris/Desktop/Int_C/code.so
  Expected in: flat namespace
 in /Users/Thodoris/Desktop/Int_C/code.so

我猜 R 尝试查找库的方式有问题？ 有什么想法可以解决这个问题吗？

Answer 1

您没有链接到 GSL。

您可能想要模仿的一个包是我的 RcppZiggurat执行此操作的包:

PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "RcppGSL:::LdFlags()"`

即它有一个函数通过调用我的 RcppGSL 返回正确的库位置。包在其包启动时学习该位置一次。