Bash 传递不在循环第 i 个元素中的文件名

Question

在简单的文件处理中，您想要对目录中的每个文件执行某些操作，可以执行如下操作:

for i in file1 file2 file3 file5
do
echo "Processing $i"
done

我想要在这里做的是将 $i 以及非 $i 文件作为参数传递给命令。假设我的目录包含 4 个文件(file1、file2、file3、file5)。例如，在循环的第一次迭代中，当处理 file1 时，我想将其余文件(file2、file3、file5)传递给命令的 -b 参数。

例如，bash 中的循环的第一次迭代应如下所示:

FILES=/path/to/directory
for i in $FILES
do
bedtools intersect -a $i -b file2 file3 file5
done

在第二次迭代中，由于 file2 位于 $i 中，其余文件将传递给 -b 参数。

for i in $FILES
do
bedtools intersect -a $i -b file1 file3 file5
done

对于目录中的所有文件，依此类推。简而言之，将当前文件传递给 -a 参数，并将其余文件传递给 -b 参数。

如果有人能帮助我解决这个问题，那就太好了。谢谢。

Answer 1

您可以只使用数字循环并从数组中取出切片:

shopt -s nullglob
files=( path/to/directory/* )

for (( i = 0; i < ${#files[@]}; ++i )); do
    file=${files[i]}
    others=( "${files[@]:0:i}" "${files[@]:i+1}" )
    bedtools intersect -a "$file" -b "${others[@]}"
done

此循环遍历数组 files 的索引，并对当前索引 i 之前和之后的部分进行切片，以获取其他。