Graphviz:如何在带有子图簇的非常大的图上使用neato？

Question

我有一个很大但不是很大(？)的图，有 13 个子图簇，包含大约 100 个节点和 3,147 条边。

Windows 上的点崩溃，Linux 上的段错误。

This question建议解决方案是使用 neato，而不是 dot。

但是，this page说

Please note there are some quirks here ... only the DOT and FDP layout methods seem to support subgraphs

无论放大多远，我的输出都是一个巨大的黑色意大利面球。因此，我删除了除一条消息之外的所有消息，这表明子图形似乎是相互嵌套绘制的。

它们绝对不嵌套在源文件中；这是一个示例，其中商业敏感名称已更改:

digraph G {
       labelloc="t";    // place the label at the top (b seems to be default)
       label="XXX message passing";
         rankdir = "LR"
         newrank = "true"

         subgraph cluster_AAA {
              label="AAA"
              rank="same"

            AAA_1
          }

         subgraph cluster_BBB {
              label="BBB"
              rank="same"

            BBB_1
            BBB_2
          }

         subgraph cluster_CCC {
              label="CCC"
              rank="same"

            CCC_1
            CCC_2
            CCC_3
          }

这在语法上似乎是正确的(边缘在后面)。

所以，链接页面似乎是正确的:

only the DOT and FDP layout methods seem to support subgraphs

但是，看起来我也需要neato来绘制大图。

我有什么选择？

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[Updtae] 我运行 fdp 并收到以下错误消息

Error: node "xxx" is contained in two non-comparable clusters "AAA" and "BBB"

这似乎给出了线索​​。难道一个节点名真的不能在两个集群中使用吗？

如果是这样，解决方案似乎是在节点名称之前加上集群名称......

Answer 1

所以我没有通用的解决方案来解决您的问题。 但你看过“火星”吗？ 它是一个命令行工具，专为使用具有非常大的图形的 graphviz 程序而设计。 您可以在这里找到它:https://github.com/marckhoury/mars