我试图使用 RCY3 包创建 Cytoscape 网络。当我运行以下代码时，我收到以下错误消息-
createNetworkFromDataFrames(edges = edge_df，nodes = NULL，title =“基因共表达网络”)
curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) 中出现错误:无法识别的内容编码类型。 libcurl 理解 deflate、gzip 内容编码。
回溯: curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) 中的错误:无法识别的内容编码类型。 libcurl 理解 deflate、gzip 内容编码。 7. curl ::curl_fetch_memory(url, 句柄 = 句柄) 6.request_fetch.write_memory(req$output, req$url, 句柄) 5.request_fetch(请求$输出，请求$url，句柄) 4.request_perform(请求, hu$handle$handle) 3.POST(url = URLencode(q.url), body = q.body, 编码 = "json", content_type_json()) 2.cyrestPOST(“网络”，参数=列表(标题=标题，集合=集合)，主体= json_network，base.url = base.url) 1.createNetworkFromDataFrames(edges=edge_df,nodes=NULL,title=“基因共表达网络”)
curl 包已安装并加载到工作流程中。我见过有人有类似的问题。不幸的是，这些问题都与 cytoscape/rcy3 或 R 无关，我无法从现有答案中解决它。
edge_df 数据框如下所示 -
感谢您的帮助。
真诚的， 拉赫曼
最佳答案
这是 RCy3 项目的一个已知错误，已在本月底的下一个 Bioconductor 版本中修复。您可以同时安装开发版本。 https://github.com/cytoscape/RCy3
关于r - curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) :无法识别的内容编码类型。 libcurl 理解 deflate、gzip 内容编码，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/64251833/