repast-simphony - 就餐西蒙尼 : Using unrolled parameter files for batch runs

Question

我想在 headless 模式下使用 Repast Simphony 的批处理运行器，并使用展开的参数文件来避免使用 nxn 实验设置。我已设法使用控制台和参数文件创建一个 jar，但无法找到实际启动所创建的模型 jar 的方法，因为在使用自定义展开的参数文件时 -run 选项似乎无效。

有人对如何继续进行有一些建议吗？

Answer 1

目前，无法使用自定义 upf 并让 simphony 对 upf 进行分块并在不同的主机上分发和运行这些 block 。您可以使用 -u/--upf 参数将自定义 upf 包含在有效负载中，然后通过 slurm 或 PBS 调度程序在 HPC 系统上运行它。批处理运行入门文档中有相关说明。

这些 HPC 运行使用单独运行 upf 文件的某些 block 的脚本。这对您来说可能是一个有用的解决方法。

sed -n "$begin","$end"p "$paramFile" > localParamFile.txt
mkdir $instanceDir
cd $instanceDir

java -Xmx512m -cp "../lib/*" repast.simphony.batch.InstanceRunner \
            -pxml ../scenario.rs/batch_params.xml \
            -scenario ../scenario.rs \
            -id $instance \
            -pinput localParamFile.txt

这里的想法是，sed 用于对从 $begin 行开始到 $end 行结束的 upf 文件进行分块，并将其写入 localParamFile.txt 中。然后，InstanceRunner 启动，迭代该文件中的每一行，并使用每一行作为输入来执行模型运行。

您可以调整此设置并手动对自定义文件进行分块，然后运行 ​​InstanceRunner。