r - 一张大 table 或多张小 table

Question

我已经阅读了该网站上的 MonetDB.R/MonetDBLite 帖子、CRAN PDF 以及 MonetDB 网站上的一些文档，并承认自己处于看似陡峭的学习曲线的底部。

MonetDBLite 文档列出了一些函数，并附有书面警告，表明它们并不是真正要直接调用的。在 R 中使用 MonetDB.R 函数时，会出现一条警告，指出该函数已被弃用，请考虑使用 MonetDBLite。

我的数据集约为 1 亿行 x 60 个因子列，目前占用 30 个已保存到 rds 文件的 data.frame。我没有足够的内存来在 R 中处理整个数据，因此我想将其全部转储到 MonetDB 中并仅提取特定任务所需的数据。

如果我选择每个 data.frame 一个表范例，什么 R 脚本将对 MonetDB 数据库中的所有表运行查询？我认为这是某种类型的 JOIN。这可以通过 CREATE VIEW 来完成吗？

如果我选择一个大表范例，什么 R 脚本将允许我附加到现有的 MonetDB 表？

任何指导将不胜感激。以下是我到目前为止能够拼凑的内容:

library( MonetDB.R )
library( MonetDBLite )
library( DBI )
library( digest )

dbDir <- 'myDirectory'

#
#   Create connection to database
#
conn  <- dbConnect( MonetDBLite(), dbDir )

#
#   Get data.table
#
f <- choose.files( default='directory to rds files', 
                       caption="select files for processing:",
                       multi=FALSE )

dt <- readRDS( file=f )

# extract file name without extension
tblName <- sub( "^([^.]*).*", "\\1", basename( f ) )

#
#   Add data.table to db
#
dbWriteTable( conn, tblName, dt )

#
#   Count rows
#
qryStr <- paste( "SELECT COUNT(*) FROM", tblName )
dbGetQuery( conn, qryStr )

#
#   After loading a few tables, stitch together into one view
#
viewStr <- "CREATE VIEW big_tbl AS
            SELECT * FROM (
                SELECT 'table1' AS type, table1.* FROM table1
                UNION ALL
                SELECT 'table2' AS type, table2.* FROM table2
                UNION ALL
                SELECT 'table3' AS type, table3.* FROM table3
            ) AS big_tbl_table"

dbGetQuery( conn, viewStr )

# dbListTables( conn )
#[1] "big_tbl" "table1"        
#[3] "table2" "table3"      

#
#   Get VIEW into R
#
library( dplyr )

mdb     <- src_monetdb( embedded=dbDir )
bigView <- tbl( mdb, 'big_tbl' ) # Error: select is not a character vector
bigView <- tbl( mdb, 'table1' )

#
#   Disconnect from db
#
dbDisconnect( conn )

Answer 1

所有小表都具有相同的架构/列吗？在这种情况下，我将使用 dbWriteTable() 将它们全部放入一个大表中，并将 append 标志设置为 TRUE。