dicom - 查找在同一扫描 session 中获取的两个 MR 数据集的相同切片位置的坐标 (mm)

Question

我有两次 MR 采集，其中第一个是 3D 采集 (1x1x1 mm3)，第二个是 2D 采集(2.24 x 2.24 x 5.00 mm，轴向切片)。高分辨率数据集是全头 3D 采集，如果沿轴向重新切片(采集中方向最初为矢状)，则可提供 176 个切片。 2D 采集仅包含 3 个轴向切片，这些切片被选择用于针对大脑中的特定区域并连续采集。

假设对象在扫描之间没有移动并且这些数据集是在同一扫描 session 中获取的，是否可以知道 3D 高分辨率数据集中的哪些切片与 2D 数据集中的 3 个切片准确对应？ 我正在查看这两个数据集的 dicom，并尝试使用 ImageOrientationPatient 和 ImagePositionPatient 标签来尝试准确找出 2D 扫描中切片相对于磁铁等中心点的坐标。这样我就可以知道 2D 采集中第一个切片相对于磁体等角点的确切坐标，并假设两个扫描共享相同的原点，然后我可以准确地知道坐标对应于 3D 扫描中的哪个轴向切片？ 我面临的问题是，两次采集的 ImageOrientationPatient 矢量都不同，因为高分辨率是通过矢状方向规范获取的(尽管是 3d 并且可以获取任何方向的切片)，而 2D 数据是专门作为轴向切片获取的。

有 dicom 处理经验的人可以告诉我如何链接这两个扫描吗？由于这是相同的扫描 session ，我假设这两次采集的引用位置应该相同。这是正确的吗？

Answer 1

仅当所有图像均在一次扫描中拍摄时，ImagePositionPatient 才能可靠地引用相同的坐标系。不幸的是，没有“对患者进行校准”来确保特定坐标始终引用同一患者的相同位置。

假设您的扫描就是这种情况，那么任务非常简单。每次扫描的完整几何形状由以下定义:

• ImagePositionPatient (0020,0032) - 每个切片的左上角像素的坐标

• ImageOrientationPatient (0020,0037) - 每个切片的方向向量，即像素行和列对齐的轴

• PixelSpacing (0028,0030) - 每个像素的高度和宽度(是的，y 维度首先出现!)

既然您精确地知道了两次扫描中每个切片的每个像素的位置，剩下的任务就是在 3D 扫描的维度中表达 2D 扫描的左上角像素。我会使用坐标变换来做到这一点，但其他方法也可以。