r - 将列值与第一行进行比较并保留 R 中的原始值

Question

我有一个很大的(当然)光谱数据矩阵，每列代表不同的质量值，行代表分析中的样本。一个小例子...

mydata <- matrix(c(c(1.95,6,1,0),c(1.76,3,2,14),c(3.67,2,1.55,7),c(0.57,3,8,12),c(2.33,3,16,2)),nrow = 4, ncol = 5)
rnames <- c("threshold", "S1", "S2", "S3")
row.names(mydata)<- rnames

#           [,1]  [,2] [,3]  [,4]  [,5]
# threshold 1.95  1.76 3.67  0.57  2.33
# S1        6.00  3.00 2.00  3.00  3.00
# S2        1.00  2.00 1.55  8.00 16.00
# S3        0.00 14.00 7.00 12.00  2.00

第一行表示阈值，要考虑的样本值必须是阈值的 3 倍。我想将第一行值与列中后续行中的所有值进行比较，如果单元格值 =>3x 第一行值，则返回单元格值，否则将单元格替换为“0”。

因此，对于小样本数据，我希望实现的输出矩阵如下所示:

mydata2 <- matrix(c(c(1.95,6,0,0),c(1.76,0,0,14),c(3.67,0,0,0),c(0.57,3,8,12),c(2.33,0,16,0)),nrow = 4, ncol = 5)
row.names(mydata2) <- rnames

#           [,1]  [,2] [,3]  [,4]  [,5]
# threshold 1.95  1.76 3.67  0.57  2.33
# S1        6.00  0.00 0.00  3.00  0.00
# S2        0.00  0.00 0.00  8.00 16.00
# S3        0.00 14.00 0.00 12.00  0.00

我认为有一种方法可以使用 apply 来运行它，但我对 R 的了解还没有延伸到那么远。

我应该注意到，阈值(第一)行最初是一个单独的 1xn 矩阵，使用 InsertRow 将其插入到第一行中。如果将数据矩阵与“阈值”矩阵进行比较，而不是比较矩阵内的行，那就更好了。

感谢您帮助解决此问题!

Answer 1

您可以将矩阵的第一行重复到与其余行相同的大小。然后进行比较，得到一个 bool 矩阵。将其与原始值相乘。

mydata[-1, ] <- mydata[-1, ] * (mydata[-1, ] >= 3 * mydata[rep(1, nrow(mydata) - 1), ])

mydata
#           [,1]  [,2] [,3]  [,4]  [,5]
# threshold 1.95  1.76 3.67  0.57  2.33
# S1        6.00  0.00 0.00  3.00  0.00
# S2        0.00  0.00 0.00  8.00 16.00
# S3        0.00 14.00 0.00 12.00  0.00

---

如果您的阈值存储在单独的矩阵中，则可以使用相同的原理。