read.xlsx 需要很长的时间和大量的内存

Question

我正在尝试将 .xlsx 文件加载到 R 中，该文件只有一张表，大小约为 31 MB。

我运行以下内容

options( java.parameters = "-Xmx6g" )
require(xlsx)
yt = read.xlsx("big_spreadsheet.xlsx",1)

我什么也没得到。我的系统监控程序显示分配的内存慢慢填满，然后一直保持满状态。我没有让它运行几个小时，但十分钟应该足够了，特别是当我可以刚刚加载到 Numbers 中(我在 Mavericks 上)并将其保存为 CSV 时。

是的，我的内存远远超过 6 GB。 2 GB 似乎不够，并产生错误:

Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl,  : 
  java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space

但是，我确实犯了一个错误，让 rJava 包安装它自己的 Java 版本。我事后下载了 JDK 8，但我不知道如何检查它是否正在使用。

那么为什么需要 6 GB RAM 才能加载 31 MB 文件(无法加载)？我能以某种方式解决这个问题吗？

Answer 1

我从来没有让它发挥作用。我最近一直在使用readxl用于读取 Excel 电子表格的包，它没有 Java 依赖性，并且似乎工作得很好。