stdout - PBSPro qsub 输出错误文件定向到名称中包含 jobid 的路径

Question

我正在使用 PBSPro 并尝试使用 qsub 命令行提交作业，但似乎无法按照我想要的方式命名输出和错误文件。目前使用:

  qsub -N ${subjobname_short} \
       -o ${path}.o{$PBS_JOBID} -e ${path}.e${PBS_JOBID}
       ... submission_script.sc

Where $path=fulljobname      (i.e. more than 15 characters)

我知道 $PBS_JOBID 在作业提交后才会设置...

有什么想法吗？

谢谢

Answer 1

我想出的解决方案是在 qsub 命令之后使用 qalter 命令，如下所示:

jobid=$(qsub -N ${subjobname_short} submission_script.sc)
qalter -o ${path}.o{$jobid} -e ${path}.e${jobid} ${jobid}

这样，PBS Pro 就不需要解析变量，因为它在我们的安装中未能这样做(这可能是配置问题)