python - 带有空变量和 0 维对象数据框的 xarray 和 netCDF 文件

Question

我正在尝试使用 xarray 将一些 .nc 文件转换为 pandas 数据帧。

这是 netCDF 文件之一:

ftp://l5ftl01.larc.nasa.gov/MISR/MIL2ASAE.003/2017.08.31/MISR_AM1_AS_AEROSOL_P006_O094165_F13_0023.nc

代码:

import xarray as xr
ds = xr.open_dataset("MISR_AM1_AS_AEROSOL_P006_O094165_F13_0023.nc")
df = ds.to_dataframe()

错误:

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "C:\Users\abreucbr\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\py36\lib\site-packages\xarray\core\
dataset.py", line 3088, in to_dataframe
    return self._to_dataframe(self.dims)
  File "C:\Users\abreucbr\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\py36\lib\site-packages\xarray\core\
dataset.py", line 3078, in _to_dataframe
    index = self.coords.to_index(ordered_dims)
  File "C:\Users\abreucbr\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\py36\lib\site-packages\xarray\core\
coordinates.py", line 80, in to_index
    raise ValueError('no valid index for a 0-dimensional object')
ValueError: no valid index for a 0-dimensional object

例如，如果我检查 ds 变量，

ds.variables

我明白了

Frozen(OrderedDict())

.nc 文件有几 MB，因此它看起来并不“空”。

这里有什么问题吗？

Answer 1

您的数据集似乎设置为 groups 的层次结构。 Xarray 的 open_dataset功能仅支持一次打开一个组。因此，您一次只需打开一组。像这样的东西:

xr.open_dataset("MISR_AM1_AS_AEROSOL_P006_O094165_F13_0023.nc", group='4.4_KM_PRODUCTS')

一般来说，to_dataframe 方法对数据集的实用性有限，因为将 6 个维度折叠成单个索引将非常笨重/低效。