c++ - 没有调用 sqrt 的匹配函数

Question

在 Rcpp 中编写一个用于按列计算样本偏度的函数 我在使用 sqrt() 函数时遇到了麻烦。我知道 sqrt(x) 适用于 NumericVector 类型(在单独的文件中对其进行了测试)，但是在我的代码中(我试图传递 double )它不起作用。

这是我的代码:

#include <Rcpp.h>
#include <cmath>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
NumericVector colSkew(NumericMatrix x) {
    int nc = x.ncol();
    int nr = x.nrow();
    NumericVector colS(nc);
    for(int i = 0; i < nc; i++){
        double cMean = mean(x( _ ,i));
        double xSq = 0;
        double cSt = 0;
          for(int j = 0; j < nr; j++){
              xSq += std::pow(x(j,i), 2.0);
              cSt += std::pow(x(j,i) - cMean, 3.0);
          }
          double colMsq = nr * std::pow(cMean, 2.0);
          double cTT = sqrt((xSq - colMsq)) / (nr - 1);
          double colVar = cTT / (nr - 1);
          double colNew = nr * std::pow(colVar, 3);
          colS[i] = cSt / colNew;
      }
    return(colS);
}

我尝试了 std::sqrt() 相反，给了我“对 sqrt 的调用不明确”错误。对于那个，两者都不是Getting: error C2668: 'sqrt' : ambiguous call to overloaded function ，也不是 http://dirk.eddelbuettel.com/code/rcpp.examples.html的

inline static double sqrt_double( double x ){ return ::sqrt( x ); }

有帮助。 (后一个问题本身要么是“没有匹配功能”，要么是“模糊”问题)。 代码本身可以编译，但无法正常工作(我可以调用该函数，但结果不好)。

可重现的示例:

# First load the cpp function, however you want to;
Create example data:
A = matrix(rchisq(1000, 5), nrow = 100)
library(timeDate)
skew.1 = apply(A, 2, skewness)
skew.2 = colSkew(A)

# A custom R-function which should mimic the cpp function
colSkew.r = function(x){
  
  nc = ncol(x)
  nr = nrow(x)
  colS = numeric(nc)
  cMean = colMeans(x)
  xSq = colSums(x^2)
  cSt = 0
  for(i in 1:nc){
      cSt = sum((x[,i]-cMean[i])^3)
      colMsq = nr * cMean[i]^2
      cTT = sqrt((xSq[i] - colMsq) / (nr - 1))
      colNew = nr * cTT^3
      colS[i] = cSt / colNew
  }
  return(colS)
}
skew.3 = colSkew.r(A)

Answer 1

简而言之，我们可以避免一些经常出现的常见初学者错误:

• 不要包含不需要的 header (大部分是无害的，但 Rcpp 已经带来了数学 header )

• 不要使用全局扁平化命名空间Rcpp，尤其是在符号可见性出现编译错误之后

有了这个以及所需的最小更改，它就会构建并运行(并返回一些无意义的内容，但我将其留给您来解决:)

还有其他方法可以解决这个问题，因为 std:: 符号和 Rcpp 符号通常与不同的签名非常愉快地共存。

代码

#include <Rcpp.h>

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::NumericVector colSkew(Rcpp::NumericMatrix x) {
    int nc = x.ncol();
    int nr = x.nrow();
    Rcpp::NumericVector colS(nc);
    for(int i = 0; i < nc; i++){
      double cMean = Rcpp::mean(x( Rcpp::_ ,i));
        double xSq = 0;
        double cSt = 0;
          for(int j = 0; j < nr; j++){
              xSq += std::pow(x(j,i), 2.0);
              cSt += std::pow(x(j,i) - cMean, 3.0);
          }
          double colMsq = nr * std::pow(cMean, 2.0);
          double cTT = std::sqrt((xSq - colMsq)) / (nr - 1);
          double colVar = cTT / (nr - 1);
          double colNew = nr * std::pow(colVar, 3);
          colS[i] = cSt / colNew;
      }
    return(colS);
}

/*** R
set.seed(42)
colSkew( matrix(rnorm(100), 100, 1) )
*/

输出

> sourceCpp("answer.cpp")

> set.seed(42)

> colSkew( matrix(rnorm(100), 100, 1) )
[1] -448250877
>