我正在尝试使用 org.Hs.eg.db 中的 Entrez 基因 ID 来注释基因符号。 我在使用之前做过:
select(org.Hs.eg.db, keys=mykeys, columns=c("SYMBOL", "ENTREZID"), keytype="SYMBOL")
mykeys 是基因符号的向量。 它以前有效，但我没有得到:
`error in usemethod( depth ) no applicable method for 'select_'applied to an object of class "c('OrgDb', 'AnnotationDb', 'envRefClass', '.environment', 'refClass', 'environment', 'refObject', 'AssayData')`"
有人可以帮忙吗？ 提前致谢!!
最佳答案
好的，我自己解决了:
AnnotationDbi::select(org.Hs.eg.db,keys=mykeys,columns=c("SYMBOL","ENTREZID"),keytype="SYMBOL")
关于r - 从注释数据库中选择注释的函数不起作用，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/65180859/