c++ - 使用外部 C 库在 Rcpp 中编译 C++

Question

我正在尝试使用使用外部库的 Rcpp 代码构建 R 包。我之前曾问过关于如何在包 here 中使用外部 C 库的问题。我面临的问题是一旦包含以下代码行

y = N_VNew_Serial(3);

我遇到了错误

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

我没有收到这条线的错误

N_Vector y = NULL;

因此，我认为与图书馆的连接工作正常。我还确认了 N_VNewSerial() 的函数声明在 nvector/nvector_serial.h 中如果您需要查看整个包代码，可以使用 here

特定 Rcpp 文件的代码粘贴在下面

#include <Rcpp.h>

// #include <iostream.h>
#include <cvode/cvode.h>               /* prototypes for CVODE fcts., consts. */
#include <nvector/nvector_serial.h>    /* serial N_Vector types, fcts., macros */
#include <cvode/cvode_dense.h>         /* prototype for CVDense */
#include <sundials/sundials_dense.h>   /* definitions DlsMat DENSE_ELEM */
#include <sundials/sundials_types.h>   /* definition of type realtype */

using namespace Rcpp;

void InitialConditions (NumericVector x){

  N_Vector y = NULL;
  // y = N_VNew_Serial(3);
  //
  // NV_Ith_S(y,0) = 1;
  // NV_Ith_S(y,1) = 2;
  // NV_Ith_S(y,2) = 3;


}

我不确定为什么代码在同一个头文件中报告一个函数的undefined reference 而不是另一个函数，如果能帮助理解解决这个错误，我们将不胜感激。

谢谢!

SN248

Answer 1

这是一个链接错误，而不是编译错误。编译成功让你进入链接步骤。但是

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): \
  undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

非常清楚:R 无法构建共享库，因为您没有链接提供它的目标代码(我想是来自日晷)。