python - 在 Unix 中基于部分匹配删除文件

Question

假设我有一个名为 duplicates.txt 的文件，如下所示:

ID-32532
ID-78313
ID-89315

我还有一个 Fastq 目录，其中包含以下名称的文件:

ID-18389_Feb92003_R1.fastq
ID-18389_Feb92003_R2.fastq
ID-32532_Feb142003_R1.fastq
ID-32532_Feb142003_R2.fastq
ID-48247_Mar202004_R1.fastq
ID-48247_Mar202004_R2.fastq

我想输入一个命令来搜索 duplicates.txt 并在 Fastq 目录中找到名称部分匹配的任何文件并删除该文件。根据提供的示例，这将删除名为 ID-32532_Feb142003_{R1/R2}.fastq 的文件。

我应该使用什么 Unix 命令，或者如果需要我可以用 Python 编写脚本。

Answer 1

这里有一个小的 bash 函数可以做到这一点:

lrmduplicates(){

  while read -r dupe;
  do
    echo removing "$dupe" ;

    #fine tune with ls first...
    #ls Fastq/$dupe*

    rm Fastq/$dupe*

  # dupes file: dont forget a line feed after 3rd pattern
  # i.e. end on empty line.
  done < duplicates.txt
  
}

为了获得额外奖励，在不匹配时抑制错误。不知道自己该怎么做。 rm -f 或 rm 2>/dev/null 没有这样做(macos 上的 zsh)。