我有一个共现矩阵,我想将其转换为 igraph 对象。该矩阵具有三列 - node1
、node2
和 freq
。
我使用 graph_from_edgelist
命令创建了图形。
g <- graph_from_edgelist(as.matrix(coOccurDf[1:n,1:2]), directed=F)
我现在需要为边缘分配权重。我尝试使用两个函数,它们似乎都在做同样的工作,但无济于事。
set.edge.attribute(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)
和
set_edge_attr(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)
这两个命令都不会引发错误,但是当我尝试使用以下命令查看权重时
E(g)$weight
它只是显示NULL
。
如有任何帮助,我们将不胜感激。
最佳答案
您可以按如下方式返回 igraph
对象的权重:
edge.attributes(g)$weight
E(g)$weight
您可以通过分配给以下任一对象来设置 igraph
对象的权重:
edge.attributes(g)$weight <- coOccurDf[1:n,]$freq
E(g)$weight <- coOccurDf[1:n,]$freq
要使用 set.edge.attribute
函数,它会返回一个分配了权重的新图。将其分配给对象 g
而不是将加权图打印到控制台:
g <- set.edge.attribute(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)
关于r - 将边缘权重分配给 R 中的 igraph 对象,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/33813835/