R 无法在 conda 环境中加载 igraph

Question

我正在尝试在 Windows 上的 Ubuntu 的 WSL2 安装中运行 RShiny 应用程序。我不是 R 方面的专家，但我觉得这是一个问题，因为 conda 与 R 交互。我运行以下命令:

conda create -n r_env r-essentials r-base
conda activate r_env
conda install -c conda-forge r-shiny
conda install -c r r-visnetwork
conda install -c conda-forge r-dplyr
conda install -c r r-dt
conda install -c conda-forge r-igraph
conda install -c r r-leaflet
conda install -c conda-forge r-rgdal
conda install -c r r-shinydashboard
conda install -c conda-forge r-shinywidgets
conda install -c conda-forge r-shinycssloaders
conda install -c conda-forge r-igraph

当我运行 R 并输入:library(igraph) 我得到:

->Error: package or namespace load failed for ‘igraph’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/home/carlo/anaconda3/envs/r_env/lib/R/library/igraph/libs/igraph.so':

但我可以列出它，它就在那里:

ll /home/carlo/anaconda3/envs/r_env/lib/R/library/igraph/libs/igraph.so
-> -rwxrwxr-x 1 carlo carlo 3816608 Mar 31 15:38 /home/carlo/anaconda3/envs/r_env/lib/R/library/igraph/libs/igraph.so

有没有人遇到过类似的问题？

igraph 库旨在正确加载

Answer 1

(我的意见)我会警告不要使用 r channel 和 r-essentials 包。 Continuum/Anaconda 对 R 的支持是一个很好的大学尝试，但已经过时并被 Conda Forge 提供的更广泛的 CRAN 支持所取代。管理 R 环境的用户将发现更好的体验，忽略任何 Continuum/Anaconda 文档并专门将 Conda Forge 用于他们的 R 环境。 (结束意见)

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混合 channel 可以lead to symbol reference errors .此外，临时安装序列低于标准 - 而不是通过 YAML 指定。

以下 YAML 文件在 linux-64、osx-64 和 win-64 平台上运行良好:

so-igraph.yaml

name: so-igraph
channels:
  - conda-forge
dependencies:
  - r-base=4.1  # adjust to desired version
  - r-shiny
  - r-visnetwork
  - r-dplyr
  - r-dt
  - r-igraph
  - r-leaflet
  - r-rgdal
  - r-shinydashboard
  - r-shinywidgets
  - r-shinycssloaders
  - r-igraph

可以搭配使用

conda env create -n so-igraph -f so-igraph.yaml
conda activate so-igraph