r - 当行位置是动态的时，将变量分配给数据框中的特定单元格

Question

这里的目标是自动化数据处理管道，我可以在其中读取 .csv 文件并运行脚本并输出处理后的文件，为数据绘图做好准备。我所做的只是对几列应用一些操作，但自动化一个步骤对我来说还不清楚:

我需要将一列中的值除以另一列中的值，但在除法之前我需要从特定单元格中减去一个值。但是，在每个不同的 .csv 中，特定的单元格位置都会发生变化，因此我不能简单地将列/行单元格提取为变量并使用它。作为示例数据框:

df<-

sampleid  t1    t2
a1        4     15
a2        3     18
a3        7     30
b1        6     17
blank     1     5

函数将是

df <- df %>% mutate(ri=(t1-1)/(t2-1))

其中 t1 和 t2 减去“1”来自“空白”行“t1”值。我想创建一个该单元格值的变量，以代入该方程式(有时它不是 1)。 csv/data frame 中的特定行会根据总样本数发生变化，所以我不能每次都选择一个固定的单元格。

理想情况下应该是

df <- df %>% mutate(ri=(t1-x)/(t2-x))

其中“x”被分配给数据框中的空白 t1 值。

有什么好方法可以做到这一点？谢谢。

Answer 1

您可以将变量 x 添加为一列，然后使用您的公式(然后再次删除 x):

library(tidyverse)

df <- read.table(text = "sampleid  t1    t2
a1        4     15
a2        3     18
a3        7     30
b1        6     17
blank     1     5", header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE)

df %>%
  mutate(x = df %>%
           filter(sampleid == "blank") %>%
           pull(t1)) %>%
  mutate(ri = (t1 - x) / (t2 - x)) %>%
  select(-x)

# sampleid t1 t2        ri
# 1       a1  4 1 0.2142857
# 2       a2  3 1 0.1176471
# 3       a3  7 1 0.2068966
# 4       b1  6 1 0.3125000
# 5    blank  1 1 0.0000000