bash - 在循环中重命名匹配模式的文件 - Bash

Question

我一直在尝试根据表格重命名一些特定文件，但没有成功。它要么重命名所有文件，要么给出错误。

该目录包含数百个以长条形码命名的文件，我只想重命名包含模式 _1_ 的文件。

例子

barcode_1_barcode_SL484171.fastq.gz   barcode_2_barcode_SL484171.fastq.gz   barcode_1_barcode_SL484370.fastq.gz   barcode_2_barcode_SL484370.fastq.gz

我的表格.txt

<表类="s-表"> <头> 旧名 新名字 <正文> barcode_1_barcode_SL484171 描述1 barcode_2_barcode_SL484171 描述1 barcode_1_barcode_SL484370 描述2 barcode_2_barcode_SL484370 描述2

期望输出:

描述1.R1.fastq.gz 描述2.R1.fastq.gz

如您在表中所见，每个描述有两个文件，但我只想重命名具有 _1_ 模式的文件。

我试过的代码:

for i in *_1_*.fastq.gz; do read oldname newname; mv "$oldname" "$newname".R1.fastq.gz; done < mytable.txt

for i in $(grep '_1_' mytable.txt); do read -r oldname newname; mv ${oldname} ${newname}.R1.fastq.gz; done < mytable.txt

for i in $(grep '_1_' mytable.txt); do oldname=$(cut -f1 $i);newname=$(cut -f2 $i); ln -s ${oldname} ${newname}.R1.fastq.gz; done

Answer 1

while read -r oldname newname
do 
    if [[ $oldname =~ "_1_" ]]
    then 
        mv $oldname $newname
    fi
done < mytable.txt