我正在尝试在 R 中安装软件包,但下载后,加载软件包库将无法工作 - 在运行 require("<package_name>")
时或library("<package_name>")
我收到错误:
Error in library("package_name") : there is no package called ‘package_name’
我在 Ubuntu 14.04.1 上运行 R 3.0.2,它安装在 os x mavericks 内运行的 vagrant 虚拟机中。
我尝试重新安装所有内容(R、Ubuntu、sudo apt-get --reinstall install r-base-dev
)。我尝试过以 root 身份运行 R,但没有成功。
我发现了这个问题的另外两个帐户:
Ubuntu 12.04 R install.packages() does not work. No warning, no install
install.packages() Rstudio server AWS ubuntu error
并尝试了建议的解决方案,但它们都不适合我。
更多关于我的安装过程的背景知识;以下是我在 ubuntu 中安装 R 时使用的命令序列:
sudo apt-get update
echo "deb http://http://ftp.osuosl.org/pub/cran/bin/linux/ubuntu trusty/" >> ./sources.list.appendme
sudo cat /etc/apt/sources.list ./sources.list.appendme > ./sources.list.tmp
sudo mv ./sources.list.tmp /etc/apt/sources.list
rm ./sources.list.appendme
sudo apt-get install r-base
sudo apt-get install r-base-dev
sudo apt-get --reinstall install r-base-dev
这遵循此处的说明:http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README用于在 Ubuntu 中安装 R。
以下是我用来制作虚拟机的安装步骤:
> vagrant box add july24
> https://cloud-images.ubuntu.com/vagrant/trusty/current/trusty-server-cloudimg-i386-vagrant-disk1.box
> vagrant init july24 vagrant up
以下是我在 OS X R 安装和 Ubunutu R 安装中运行软件包安装所获得的输出的比较。有趣的是,在 Ubunutu 尝试中下载的包大小通常要小得多(OS X R 中为 47KB 和 26KB,而 Ubuntu R 中为 14KB 和 0.9257KB)。不确定这是否是 R 版本之间的差异(OS X/Ubunutu 中的 3.0.3/3.0.2),还是因为不同操作系统的不同要求..
在 OS X 中正确、无错误地安装软件包:
install.packages("dataview",repos="http://cran.cs.wwu.edu")
还安装依赖项“xtermStyle”
正在尝试 URL 'http://cran.cs.wwu.edu/bin/macosx/contrib/3.0/xtermStyle_2.2-4.tgz ' 打开的内容类型“application/x-gzip”长度为 49060 字节 (47 Kb) 网址 ===================================================下载 47 Kb
正在尝试 URL 'http://cran.cs.wwu.edu/bin/macosx/contrib/3.0/dataview_2.0-9.tgz ' 打开的内容类型“application/x-gzip”长度为 27032 字节 (26 Kb) 网址 ===================================================下载 26 Kb
下载的二进制包在 /var/folders/sy/w_z0czvs2nqd2ys0vf_827zc0000gn/T//RtmpOlT9rM/downloaded_packages
library('dataview')
加载所需包:xtermStyle
block 引用>在 Ubuntu 中安装时出现错误:
install.packages("dataview",repos="http://cran.cs.wwu.edu")
将软件包安装到“/home/vagrant/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0”(因为“lib”是 未指定)还安装依赖项“xtermStyle”
正在尝试 URL 'http://cran.cs.wwu.edu/src/contrib/xtermStyle_2.2-4.tar.gz ' 内容 输入 'application/x-gzip' 长度 15265 字节 (14 Kb) 打开的 URL ===================================================下载 14 Kb
正在尝试 URL 'http://cran.cs.wwu.edu/src/contrib/dataview_2.0-9.tar.gz ' 内容类型“application/x-gzip”长度 9257 字节打开的 URL ===================================================下载了 9257 字节
下载的源码包在 ‘/tmp/RtmppaTkT7/downloaded_packages’
library('dataview')
库中的错误(“dataview”):没有名为“dataview”的包
library('dataview',lib.loc='/home/vagrant/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0')
库中的错误(“dataview”,lib.loc =“/home/vagrant/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0”):
block 引用>
没有名为“dataview”的包也许我缺少什么?非常感谢您的帮助或建议。
最佳答案
好的,我遇到了同样的问题...请确保为虚拟机分配足够的内存。 Vagrant 的默认虚拟机内存是 512m...将其增加到 2048m,一切都应该可以正常工作...
我在我的 vagrant 文件中使用它来增加内存:
config.vm.provider "virtualbox" do |vb|
# Use VBoxManage to customize the VM. For example to change memory:
vb.customize ["modifyvm", :id, "--memory", "2048"]
end
关于R install.packages() 不适用于 ubuntu vagrant vm,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/24940996/