r - Ubuntu 上的 JRI fatal error

Question

我已经在 Windows 7 上成功安装了 JRI 和 rJava。我现在正尝试让它在 64 位操作系统的 Ubuntu 上运行。我可以从 R 内部进行 rJava 调用，但让 JRI 工作更加困难。我正在运行 NetBeans 7.1.2，并且我遵循了设置 R_HOME 和 java.library.path 的各种技巧来加载所有类。也就是说，我已经过去了诸如“未找到jri库”和“R_HOME未设置”之类的错误消息。

从我的java代码中，我可以看到R_HOME =/usr/lib64/R。

我现在收到的错误消息是

Fatal error: you must specify '--save', '--no-save' or '--vanilla'

首次调用 Rengine 时会发生这种情况:

Rengine r = new Rengine(args,false,null);

这似乎是来自 R 的错误消息；它似乎期待一个命令行参数。我还没有看到任何带有此错误消息的帖子。有任何想法吗？谢谢，彼得

Answer 1

在此设置中使用 R 需要您以非交互模式运行 R。要解决该问题，您需要选择错误消息中给出的选项。我会先尝试 --no-save 。这可以防止 R 在运行结束时保存工作空间。在Java代码中:

String args[] = {"--no-save"};
Rengine re = new Rengine(args, false, null);