python - 在 Python 中加载 grib2 文件

Question

我正在尝试加载 grib2 文件，但我不确定这些文件是否有问题，或者我尝试加载它们的方式是否有问题。

文件提取自here (我没有从这里下载它们，而是从一个从这里获取它们的同事的文件夹中复制它们 - 所以实际上它们应该是相同的文件......，但我随后也尝试插入 ftp 地址并获得了同样的错误)。

我厌倦了pygrib

grbs = pygrib.open('pgbf2016060100.01.2016053100.grib2')

得到这个错误:

---------------------------------------------------------------------------
IOError                                   Traceback (most recent call last)
<ipython-input-20-674763ffdd1f> in <module>()
----> 1 grbs = pygrib.open('pgbf2016060100.01.2016053100.grib2')

pygrib.pyx in pygrib.open.__cinit__ (pygrib.c:2772)()

IOError: [Errno could not open %s] pgbf2016060100.01.2016053100.grib2

我试过xarray

ds = xr.open_dataset("pgbf2016060100.01.2016053100.grb2",engine='pynio')

我得到了这个错误

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TypeError                                 Traceback (most recent call last)
/software/centos6/x86_64/canopy-1.5.2/Canopy_64bit/User/lib/python2.7/site-    packages/IPython/core/interactiveshell.pyc in run_code(self, code_obj, result)
   3081             if result is not None:
   3082                 result.error_in_exec = sys.exc_info()[1]
-> 3083             self.showtraceback()
   3084         else:
   3085             outflag = 0

/software/centos6/x86_64/canopy-1.5.2/Canopy_64bit/User/lib/python2.7/site-packages/IPython/core/interactiveshell.pyc in showtraceback(self, exc_tuple,     filename, tb_offset, exception_only)
   1858                 return
   1859 
-> 1860             if issubclass(etype, SyntaxError):
   1861                 # Though this won't be called by syntax errors in the input
   1862                 # line, there may be SyntaxError cases with imported code.

TypeError: issubclass() arg 1 must be a class

我直接试了NIO

f = nio.open_file("pgbf2016060100.01.2016053100.grb2")

我得到了与 xarray 相同的错误。

有什么建议吗？

Answer 1

我在使用 pygrib 时遇到了这个问题。问题的根源是 JPEG 支持，openjpeg 或 jasper 库有问题，经过多次尝试，我做了这个步骤通过重新安装 pygrib 解决此问题:

• 删除这个库:

  yum remove openjpeg 和 yum remove jasper(我用的是 RHEL 7)

• 重新安装此库后:

  yum install openjpeg 和 yum install jasper

• 确保不再安装 grib_api 或他的替代 eccodes。之后，从源安装eccodes，按照这个instructions .安装目录对于下一步至关重要，在我的例子中，我将其安装在 /usr/local/lib/eccodes 中(我在 中创建了一个名为 eccodes 的空目录>/usr/local/lib)，此目录在 cmake 期间使用参数 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/path/to/where/you/install/eccodes.

• 最后从源代码安装 pygrib steps ，我只取消了setup.cfg中第15行的注释，设置了grib_api_dir =/usr/local/lib/eccodes(这里是安装目录的重要性)。如果安装没有问题通过 test.py 问题就已经解决了。