image - 在命令提示符下使用 imagej 打开原始文件

Question

我正在尝试创建一个 .bat 文件来读取 .bsv 文件并将它们转换为彩色 png。第一部分是使用 imagej 打开 .bsv，然后使用我添加的“全部保存”插件。我尝试制作一个宏，但它只会给我错误。我将如何在命令提示符下使用图像 j 执行以下操作:

文件->导入->raw->myfile.bsv 并选择 8 位，宽度:4000，高度:2672，到第一张图像的偏移量:0，图像数量:40，图像之间的间隙:0，小端字节顺序。

然后

插件->全部保存

感谢您提供的任何帮助!

Answer 1

使用 macro recorder (Plugins > Macros > Record...) 在 ImageJ 中，您描述的过程产生以下代码:

run("Raw...", "open=/path/to/myfile.bsv image=8-bit width=4000 height=2672 offset=0 number=40 gap=0 little-endian");
run("Save All");

如果您保存此宏文件，例如作为 mymacro.ijm，您应该能够使用这样的宏选项运行 ImageJ(取决于您的平台):

-macro mymacro.ijm

希望对您有所帮助。