r - 在 kableExtra 中使用 cell_spec 时，使表中的 NA 值只是空白单元格

Question

从 a previous question 开始，我正在使用 kableExtra 中的 cell_spec 函数来更改表格中单元格的背景颜色。如何删除 NA 文本并将 NA 单元格的背景着色为白色，以便 NA 显示为空白单元格？

下面是我的示例表，其中包含 NA 单元格。在现实生活中，列的数量是动态的，每列中有不同数量的 NA。

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output: pdf_document
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```{r setup, include=FALSE}
library(kableExtra)
library(dplyr)
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)

set.seed(2)
d <- data_frame(group = sample(LETTERS[1:5], 10, replace=TRUE), cat1=runif(10, 0, 100), cat2=runif(10, 0, 100))
d[3:5,2:3] <- NA

# Functions used to create color palette
max.val <- max(d[ , sapply(d, is.numeric)], na.rm=TRUE)
pal.fnc <- colorRamp(c("red", "yellow", "green"))

d <- d %>%
    mutate_if(is.numeric, function(x) {
  cell_spec(round(x,1), "latex", bold = F, color=grey(.3),
            background = rgb(pal.fnc(x/max.val) %>% replace(., is.na(.), 200), maxColorValue=255))
})   
```

```{r table, echo = FALSE}
kable(d,
      linesep = "",
      booktabs = T, 
      escape = F )
```

Answer 1

您可以控制 knitr options(knitr.kable.NA = '') 来抑制 NA，但这在这里不起作用，因为您正在使用值为 \\cellcolor[HTML]{C8C8C8}{\\textcolor[HTML]{4D4D4D}{NA}}"。

要使 options(knitr.kable.NA = '') 行工作，我们必须控制 cell_spec 函数仅在非 NA 值上运行，并且防止它向 NA 值添加额外的 HTML 代码。我们可以在 dplyr 中使用 case_when 到 conditionally mutate the data , 以便 NA 保持不变。为了便于阅读，我创建了一个函数 colourCell，然后在创建表之前在 mutate_if 语句中使用该函数:

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output: pdf_document
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```{r setup, include=FALSE}
library(kableExtra)
library(dplyr)

options(knitr.kable.NA = '')

# Create Data
set.seed(2)
d <- data_frame(group = sample(LETTERS[1:5], 10, replace=TRUE), cat1=runif(10, 0, 100), cat2=runif(10, 0, 100))
d[3:5,2:3] <- NA

# Functions to format cell
max.val = max(d[ , sapply(d, is.numeric)], na.rm=TRUE)
pal.fnc <- colorRamp(c("red", "yellow", "green"))

colourCell <- function(x) {
  cell_spec(round(x,1), "latex",
            bold = F,
            color=grey(.3),
            background = rgb(pal.fnc(x/max.val) %>% 
                               replace(., is.na(.), 200), maxColorValue=255))
}
```

```{r table, echo = FALSE}
d %>%
  mutate_if(is.numeric, function(x) {
    case_when(!is.na(x) ~ colourCell(x))
})  %>%
  kable(
      linesep = "",
      booktabs = T, 
      escape = F)
```