如果我使用 depmix() 和 fit() 使用 depmixS4 包拟合模型 mf，我想知道生成给定序列 s 的对数似然，我应该怎么做？
我知道在 HiddenMarkov 包中我可以使用 forwardback(s, mf$Pi, mf$...)$LL 来获得对数似然，但是我发现 depmixS4 中的 forwardbackward() 函数的工作方式不同。
最佳答案
终于我自己找到了方法，因为第一次使用 S4...
首先用depmix()初始化一个模型(depmix obj)，然后用setpars()在拟合的mf中更新参数>。之后 forwardbackward() 将起作用
init_mod <- depmix(respones, data, nstates) ## no solid value
mod <- setpars(init_mod, getpars(fm))
forwardbackward(mod)
谁知道更好的解决方案请告诉我...
关于r - 使用 R 中的 depmixS4 使用拟合模型评估序列，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/31019622/