R 无法使用聚合函数正确计算平均值

Question

不知道为什么 R 无法正确计算我的数据的平均值。我确实有很多 NA 值，但 R 一直告诉我平均值是 NA。这是一个例子:

data1=read_excel"pepper.xlsx"

data1$cultivar = as.factor(data1$cultivar)

mean = aggregate(data1[,3:4], list(data1$cultivar), mean)

<表类=“s-表”> <标题> 品种 复制 宽度 高度 <正文> BOF 1 12 14 BOF 2 10 不适用 BOF 3 不适用 15 BOF 4 不适用 不适用

而不是计算 BOF 的平均宽度11 和平均值 height为 14.5，它将高度和宽度的平均值计算为 NA。这是我的数据的过度简化。我的研究中有几个品种，并使用 aggregate 计算了每个品种的每个变量的平均值。功能。

Answer 1

更新: 不需要匿名函数(归功于 Gregor Thomas，请参阅评论)。我们可以使用:

summarise(across(where(is.numeric), mean, na.rm = TRUE))

第一个答案: 感谢 Gregor Thomas，colMeans 在这里不起作用。 我们可以使用dplyr包summarise和across

library(dplyr)

df %>% 
  group_by(cultivar) %>% 
  summarise(across(where(is.numeric),~ mean(., na.rm = TRUE)))

输出:

  cultivar replication width height
  <chr>          <dbl> <dbl>  <dbl>
1 BOF              2.5    11   14.5