我对 Rcpp
很陌生和 RcppEigen
可能这就是我自己无法弄清楚的原因:
我只想编写一个包含 Eigen 库的 C++ 函数。为了测试它是否有效,我从 http://people.math.aau.dk/~sorenh/misc/Rdocs/Rcpp/RcppSHLIB.pdf 中获取了以下示例:
#include <Rcpp.h>
#include <RcppEigen.h>
RcppExport SEXP C_spdinv_eigen ( SEXP X_ ){
using Eigen::Map;
using Eigen::MatrixXd;
typedef Eigen::Map<Eigen::MatrixXd> MapMatd;
const MapMatd X(Rcpp::as<MapMatd>(X_));
const MatrixXd Xinv(X.inverse());
return(Rcpp::wrap(Xinv));
}
但我收到以下错误:
rcpp-test.cpp:2:23: fatal error: RcppEigen.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [rcpp-test.o] Error 1
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include" -fpic -O3 -pipe -g -c rcpp-test.cpp -o rcpp-test.o
Error in Rcpp::sourceCpp("rcpp-test.cpp") :
Error 1 occurred building shared library.
编译一个只有
#include <Rcpp.h>
的脚本工作正常。RcppEigen.h
-file 位于 /usr/local/lib/R/site-library/RcppEigen/include
目录。我尝试安装 RcppEigen
与 R CMD INSTALL ...
和 install.package
: 都没有用。我的 secionInfo 是
R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=C LC_COLLATE=C LC_MONETARY=C
[6] LC_MESSAGES=C LC_PAPER=C LC_NAME=C LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=C LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] RcppEigen_0.3.2.1.1 Rcpp_0.11.1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Matrix_1.1-1.1 grid_3.0.2 lattice_0.20-27 tools_3.0.2
谢谢你的帮助!
最佳答案
你没说怎么样你试图编译你的函数。这很重要:
LinkingTo: RcppEigen
. Rcpp::depends(RcppEigen)
. 这里有很多例子,在 Rcpp Gallery和其他地方。遵循它们,但要遵循所有步骤。现在你有编译器告诉你
RcppEigen
未知。我的 Rcpp book详细构建问题在第 2 章。
关于r - fatal error : RcppEigen. h:没有这样的文件或目录,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/22596370/